Variant Browser

Feedback
Tracks
Variant Impact
Gene Search
Isotype (reference strain)
AB1 (AB1)
BRC20067 (BRC20067)
BRC20263 (BRC20263)
CB4851 (ECA243)
CB4852 (CB4852)
CB4853 (ECA246)
CB4854 (CB4854)
CB4855 (ECA248)
CB4856 (CB4856)
CB4857 (ECA250)
CB4858 (ECA251)
CB4932 (CB4932)
CX11254 (CX11254)
CX11262 (CX11262)
CX11264 (CX11264)
CX11271 (CX11271)
CX11276 (CX11276)
CX11285 (CX11285)
CX11292 (CX11292)
CX11307 (CX11307)
CX11314 (CX11314)
CX11315 (CX11315)
DL200 (DL200)
DL226 (DL226)
DL238 (DL238)
ECA1069 (ECA1069)
ECA1074 (ECA1074)
ECA1185 (ECA1185)
ECA1186 (ECA1186)
ECA1191 (ECA1191)
ECA1193 (ECA1193)
ECA1194 (ECA1194)
ECA1195 (ECA1195)
ECA1208 (ECA1208)
ECA1216 (ECA1216)
ECA1223 (ECA1223)
ECA1225 (ECA1225)
ECA1228 (ECA1228)
ECA1229 (ECA1229)
ECA1232 (ECA1232)
ECA1237 (ECA1237)
ECA1238 (ECA1238)
ECA1240 (ECA1240)
ECA1242 (ECA1242)
ECA1247 (ECA1247)
ECA1251 (ECA1251)
ECA1253 (ECA1253)
ECA1255 (ECA1255)
ECA1257 (ECA1257)
ECA1260 (ECA1260)
ECA1261 (ECA1261)
ECA1269 (ECA1269)
ECA1271 (ECA1271)
ECA1276 (ECA1276)
ECA1278 (ECA1278)
ECA1281 (ECA1281)
ECA1283 (ECA1283)
ECA1284 (ECA1284)
ECA1286 (ECA1286)
ECA1287 (ECA1287)
ECA1288 (ECA1288)
ECA1289 (ECA1289)
ECA1293 (ECA1293)
ECA1298 (ECA1298)
ECA1413 (ECA1413)
ECA1465 (ECA1465)
ECA1467 (ECA1467)
ECA1493 (ECA1493)
ECA1515 (ECA1515)
ECA189 (ECA189)
ECA191 (ECA191)
ECA2677 (ECA2677)
ECA2678 (ECA2678)
ECA2679 (ECA2679)
ECA2686 (ECA2686)
ECA347 (ECA347)
ECA348 (ECA348)
ECA349 (ECA349)
ECA36 (ECA36)
ECA363 (ECA363)
ECA369 (ECA369)
ECA372 (ECA372)
ECA396 (ECA396)
ECA592 (ECA592)
ECA593 (ECA593)
ECA594 (ECA594)
ECA640 (ECA640)
ECA701 (ECA701)
ECA703 (ECA703)
ECA705 (ECA705)
ECA706 (ECA706)
ECA710 (ECA710)
ECA712 (ECA712)
ECA722 (ECA722)
ECA723 (ECA723)
ECA724 (ECA724)
ECA730 (ECA730)
ECA732 (ECA732)
ECA733 (ECA733)
ECA738 (ECA738)
ECA740 (ECA740)
ECA741 (ECA741)
ECA742 (ECA742)
ECA743 (ECA743)
ECA744 (ECA744)
ECA745 (ECA745)
ECA746 (ECA746)
ECA760 (ECA760)
ECA768 (ECA768)
ECA777 (ECA777)
ECA778 (ECA778)
ECA807 (ECA807)
ECA812 (ECA812)
ECA923 (ECA923)
ECA928 (ECA928)
ECA930 (ECA930)
ED3005 (ED3005)
ED3011 (ED3011)
ED3012 (ED3012)
ED3017 (ED3017)
ED3040 (ED3040)
ED3046 (ED3046)
ED3048 (ED3048)
ED3049 (ED3049)
ED3052 (ED3052)
ED3073 (ED3073)
ED3077 (ED3077)
EG4347 (EG4347)
EG4349 (EG4349)
EG4724 (EG4724)
EG4725 (EG4725)
EG4946 (EG4946)
GXW1 (GXW1)
JT11398 (JT11398)
JU1088 (JU1088)
JU1172 (JU1172)
JU1200 (JU1200)
JU1212 (JU1212)
JU1213 (JU1213)
JU1242 (JU1242)
JU1246 (JU1246)
JU1249 (JU1249)
JU1395 (JU1395)
JU1400 (JU1400)
JU1409 (JU1409)
JU1440 (JU1440)
JU1491 (JU1491)
JU1530 (JU1530)
JU1543 (JU1543)
JU1568 (JU1568)
JU1581 (JU1581)
JU1586 (JU1586)
JU1652 (JU1652)
JU1666 (JU1666)
JU1792 (JU1792)
JU1793 (JU1793)
JU1808 (JU1808)
JU1896 (JU1896)
JU1934 (JU1934)
JU2001 (JU2001)
JU2007 (JU2007)
JU2016 (JU2016)
JU2017 (JU2017)
JU2106 (JU2106)
JU2131 (JU2131)
JU2141 (JU2141)
JU2234 (JU2234)
JU2250 (JU2250)
JU2257 (JU2257)
JU2316 (JU2316)
JU2464 (JU2464)
JU2466 (JU2466)
JU2478 (JU2478)
JU2513 (JU2513)
JU2519 (JU2519)
JU2522 (JU2522)
JU2526 (JU2526)
JU2534 (JU2534)
JU2565 (JU2565)
JU2566 (JU2566)
JU2570 (JU2570)
JU2572 (JU2572)
JU2575 (JU2575)
JU2576 (JU2576)
JU2578 (JU2578)
JU258 (JU258)
JU2581 (JU2581)
JU2586 (JU2586)
JU2587 (JU2587)
JU2592 (JU2592)
JU2593 (JU2593)
JU2600 (JU2600)
JU2610 (JU2610)
JU2619 (JU2619)
JU2800 (JU2800)
JU2811 (JU2811)
JU2825 (JU2825)
JU2829 (JU2829)
JU2838 (JU2838)
JU2841 (JU2841)
JU2853 (JU2853)
JU2862 (JU2862)
JU2866 (JU2866)
JU2878 (JU2878)
JU2879 (JU2879)
JU2906 (JU2906)
JU2907 (JU2907)
JU310 (JU310)
JU311 (JU311)
JU3125 (JU3125)
JU3127 (JU3127)
JU3128 (JU3128)
JU3132 (JU3132)
JU3134 (JU3134)
JU3135 (JU3135)
JU3137 (JU3137)
JU3140 (JU3140)
JU3141 (JU3141)
JU3144 (JU3144)
JU3166 (JU3166)
JU3167 (JU3167)
JU3169 (JU3169)
JU3224 (JU3224)
JU3225 (JU3225)
JU3226 (JU3226)
JU3228 (JU3228)
JU323 (JU323)
JU3280 (JU3280)
JU3282 (JU3282)
JU3291 (JU3291)
JU3318 (JU3318)
JU346 (JU346)
JU360 (JU360)
JU367 (JU367)
JU393 (JU393)
JU394 (JU394)
JU397 (JU397)
JU406 (JU406)
JU440 (JU440)
JU561 (JU561)
JU642 (JU642)
JU751 (JU751)
JU774 (JU774)
JU775 (JU775)
JU778 (JU778)
JU782 (JU782)
JU792 (JU792)
JU830 (JU830)
JU847 (JU847)
KR314 (KR314)
LKC34 (LKC34)
MY1 (MY1)
MY10 (MY10)
MY16 (MY16)
MY18 (MY18)
MY2147 (MY2147)
MY2212 (MY2212)
MY23 (MY23)
MY2453 (MY2453)
MY2530 (MY2530)
MY2535 (MY2535)
MY2573 (MY2573)
MY2585 (MY2585)
MY2693 (MY2693)
MY2713 (MY2713)
MY2741 (MY2741)
MY518 (MY518)
MY679 (MY679)
MY772 (MY772)
MY795 (MY795)
MY920 (MY920)
N2 (N2)
NIC1 (NIC1)
NIC1049 (NIC1049)
NIC1107 (NIC1107)
NIC1119 (NIC1119)
NIC166 (NIC166)
NIC1779 (NIC1779)
NIC1780 (NIC1780)
NIC1783 (NIC1783)
NIC1785 (NIC1785)
NIC1786 (NIC1786)
NIC1787 (NIC1787)
NIC1788 (NIC1788)
NIC1789 (NIC1789)
NIC1794 (NIC1794)
NIC1796 (NIC1796)
NIC1798 (NIC1798)
NIC1799 (NIC1799)
NIC1801 (NIC1801)
NIC1802 (NIC1802)
NIC1805 (NIC1805)
NIC1806 (NIC1806)
NIC1808 (NIC1808)
NIC1809 (NIC1809)
NIC1810 (NIC1810)
NIC1811 (NIC1811)
NIC1812 (NIC1812)
NIC1832 (NIC1832)
NIC195 (NIC195)
NIC199 (NIC199)
NIC2 (NIC2)
NIC207 (NIC207)
NIC231 (NIC231)
NIC236 (NIC236)
NIC242 (NIC242)
NIC251 (NIC251)
NIC252 (NIC252)
NIC255 (NIC255)
NIC256 (NIC256)
NIC258 (NIC258)
NIC259 (NIC259)
NIC260 (NIC260)
NIC261 (NIC261)
NIC262 (NIC262)
NIC265 (NIC265)
NIC266 (NIC266)
NIC267 (NIC267)
NIC268 (NIC268)
NIC269 (NIC269)
NIC271 (NIC271)
NIC272 (NIC272)
NIC274 (NIC274)
NIC275 (NIC275)
NIC276 (NIC276)
NIC277 (NIC277)
NIC3 (NIC3)
NIC501 (NIC501)
NIC511 (NIC511)
NIC513 (NIC513)
NIC514 (NIC514)
NIC515 (NIC515)
NIC522 (NIC522)
NIC523 (NIC523)
NIC526 (NIC526)
NIC527 (NIC527)
NIC528 (NIC528)
NIC529 (NIC529)
PB303 (PB303)
PB306 (ECA259)
PS2025 (PS2025)
PX179 (PX179)
QG2075 (QG2075)
QG2811 (QG2811)
QG2813 (QG2813)
QG2818 (QG2818)
QG2823 (QG2823)
QG2824 (QG2824)
QG2825 (QG2825)
QG2827 (QG2827)
QG2828 (QG2828)
QG2832 (QG2832)
QG2835 (QG2835)
QG2836 (QG2836)
QG2837 (QG2837)
QG2838 (QG2838)
QG2841 (QG2841)
QG2843 (QG2843)
QG2846 (QG2846)
QG2850 (QG2850)
QG2854 (QG2854)
QG2855 (QG2855)
QG2857 (QG2857)
QG2873 (QG2873)
QG2874 (QG2874)
QG2875 (QG2875)
QG2877 (QG2877)
QG2932 (QG2932)
QG536 (QG536)
QG556 (QG556)
QG557 (QG557)
QW947 (QW947)
QX1211 (QX1211)
QX1212 (QX1212)
QX1233 (QX1233)
QX1791 (QX1791)
QX1792 (QX1792)
QX1793 (QX1793)
QX1794 (QX1794)
RC301 (RC301)
TWN2530 (TWN2530)
TWN2542 (TWN2542)
WN2001 (WN2001)
WN2002 (WN2002)
WN2033 (WN2033)
WN2050 (WN2050)
WN2063 (WN2063)
WN2064 (WN2064)
WN2066 (WN2066)
WN2068 (WN2068)
WN2069 (WN2069)
XZ1513 (XZ1513)
XZ1514 (XZ1514)
XZ1515 (XZ1515)
XZ1516 (XZ1516)
XZ1672 (XZ1672)
XZ1734 (XZ1734)
XZ1735 (XZ1735)
XZ1756 (XZ1756)
XZ2018 (XZ2018)
XZ2019 (XZ2019)
XZ2020 (XZ2020)
XZ2211 (XZ2211)
Reference  
Alternate   

Variants

A Maximum of 1000 variants or 100kb will be queried and returned. Heterozygous calls are likely errors. When rows are yellow, it indicates the entire variant failed QC.

Hovering over a failing genotype will list the filter applied. Genotypes are shown as follows:
Passing REF  Passing ALT   Note: The variant browser now only shows hard-filtered variants. Help
CHROM:POS REF / ALT Filter AF Gene Name WormBase ID Sequence Coding Change Biotype Annotation Impact